Esto se soluciona instalando el componente:
Compatibilidad con la configuración de IIS 6 y metabase de IIS
Vamos a Inicio -> Panel de control -> Programas y características -> Activar o desactivar las características de Windows -> Internet Information Service -> Herramientas de administración web Seleccionamos el componente: Compatibilidad con la configuración de IIS 6 y metabase de IIS y lo instalamos y después de reiniciar ya podemos crear webs desde el Visual Studio 2008.Saludos
Alex.